Эдди Веддер родился в 1964 году в семье музыкантов Эдварда Северстона младшего и Кэтрин Ли Веддер. Родители развелись через год, после рождения первенца, и Кэтрин Веддер вскоре вышла замуж за состоятельного адвоката Питера Мюллера. Долгое время Эдди считал Мюллера своим родным отцом, и только после ухода отчима из семьи, его мать во всем ему призналась — впечатление, по словам Веддера, было настолько убийственное, что на некоторое время он ушел из родительского дома и начал зарабатывать первые деньги самостоятельно — в качестве коридорного в гостинице. Чуть позже Эдди устраивается на работу охранника бензоколонки и работает там несколько лет, совмещая ее с работой разнорабочего в музыкальном клубе (где вместо зарплаты, ему предоставляли бесплатные билеты на все концерты), серфингом и пением в фанковой группе Bad Radio. Веддер был вокалистом Bad Radio на протяжении двух лет. Высшим достижением группы стали несколько концертов на разогреве у мало кому тогда известных Red Hot Chili Peppers во время их калифорнийского турне. Именно тогда Эдди познакомился и подружился с барабанщиком RHCP Джеком Айронсом, впоследствии оказавшему Веддеру неоценимую услугу. В 1990 году от передозировки героина умер вокалист известной сиэтлской гранж-команды Mother Love Bone Эндрю Вуд. Лишившись яркого фронтмена группа распалась, однако гитарист MLB Стоун Госсард не планировал бросать музыкальную карьеру. Вместе со своими старыми друзьями, бас-гитаристом Mother Love Bone Джеффом Эментом, барабанщиком Soundgarden Мэттом Кэмероном и гитаристом Shadow Майком Маккриди, он записывает несколько инструменталов собственного сочинения, объединив их в The Stone Gossard`s Demo`91. Выслав демо Айронсу (к тому моменту покинувшего Red Hot Chili Peppers), он приглашает его в группу в качестве барабанщика, а заодно просит познакомить его с «каким-нибудь хорошим вокалистом». От предложения присоединиться Айронс отказывается, посчитав музыку слишком тяжелой, а демо он отдал Эдди Веддеру, так как слышал о его уходе из Bad Radio. Веддер, прослушав безымянные инструменталы, так ими вдохновился, что не только предложил свои услуги в качестве вокалиста, но и записал вокал к одному из треков, назвав получившуюся песню Alive. Эта песня так понравилась Госсарду, что он немедленно позвал Веддера в Сиэтл для совместных репетиций.
Сразу после приезда он знакомится с лидером Soundgarden Крисом Корнеллом, который пригласил его в свой проект Temple of the Dog, посвященный памяти Эндрю Вуда. Через некоторое время, после репетиций Temple of the Dog записывают свой первый и последний одноименный альбом и отправляются в небольшой тур, по окончании которого группа распадается, как и было запланировано. Госсард после прослушивания приглашает в группу барабанщика Дэйва Крузена. Доукомплектовавшаяся группа принимает название Mookie Blaylock (в честь известного бейсболиста), записывает демо и отправляется в турне на разогреве у Alice in Chains. Вскоре выходит первый альбом Mookie Blaylock под названием Ten, однако накануне выхода альбома группа вынуждена поменять название на Pearl Jam. Дальнейшую историю можно прочитать в биографии этой группы.
Эдди Веддер также принимал участие во многих других музыкальных проектах, включая саундтрэки. В 2007 году Веддер выпустил свой первый сольный альбом в форме саундтрека к фильму Into the Wild.
В 2011 году вышел 2 сольный альбом «Ukulele Songs».
